黃連出自《神農本草經》,别名味連、川連、雞爪連，屬毛茛科多年生草本植物，産于西蜀者為佳。禀天冬寒之水氣而入足少陰腎經，味苦無毒，得地南方之火味而入手少陰心經，氣味俱降陰也，有清熱燥濕，瀉火解毒，殺蟲止癢之功。

時珍曰︰五髒六腑皆有火，平則治，動則病，故有君火、相火之說，其實一氣而已。黃連入手少陰心經，為治火之主藥︰故本經謂黃連治心火之火，則生用之；肝火膽汁炒；上焦火酒炒；中焦火姜炒；下焦火鹽水炒，或童便炒；食積火土炒；濕熱在氣分，吳萸湯炒；在血分醋炒。汪昂又曰, 黃連瀉心火, 佐以龍膽瀉肝膽火; 白芍瀉脾火; 石膏瀉胃火;知母瀉腎火;黃柏瀉膀胱火; 木通瀉小腸火; 黃芩瀉肺火, 栀子佐之; 瀉大腸火, 黃連佐之。柴胡瀉肝膽火, 黃連佐之。瀉三焦火, 黃芩佐之; 繡按柴胡, 止就肝膽邪郁而言。

時珍又有曰︰黃連，治目及痢為要藥。古方治痢, 香連丸，用黃連、木香；姜連散，用幹姜、黃連；變通丸，用黃連、茱萸；姜黃散，用黃連、生姜。治消渴，用酒蒸黃連；治伏暑，用酒煮黃連；治下血，用黃連、大蒜；治肝火，用黃連、茱萸；治口瘡，用黃連、細辛。皆是一冷一熱，一陰一陽，寒因熱用，熱因寒用，君臣相佐，陰陽相濟，最得制方之妙，所以有成功而無偏勝之害也。

先師仲景治九種心下痞，五等瀉心湯而皆用之, 腹痛（清熱），心痛伏梁（心積），目痛 傷（人乳浸點或合歸、芍等分，煎湯熱洗，散熱活血），癰疽瘡疥（諸痛癢瘡，皆屬心火），酒毒胎毒（小兒初生，合甘草為末，蜜調令咽之），明目《傳信方》∶羊肝一具，黃連一兩，搗丸，名羊肝丸，凡是目疾皆治 ,定驚（鎮肝），止汗解毒，除疳（同豬肝蒸為丸）殺蛔（蛔得苦則伏）。虛寒為病者禁用（久服黃連、苦參反熱，從火化也。昂按∶炎上作苦，味苦必燥，燥則熱矣，旦苦寒沉陰肅殺，伐傷生和之氣也。韓 曰∶黃連與肉桂同行，能交心腎于頃刻。

吾學先賢之驗,總結黃連臨床之功效如下。黃連性寒味苦而氣味俱濃, 古方以黃連為治痢之最,此苦能燥濕，寒能勝熱，使氣宣平而已。諸苦寒藥多洩，惟黃連、黃柏性冷而燥，能降火去濕而止瀉痢，故治痢以之為君。若氣實初病，熱多血痢，服之便止，不必盡劑。諸痛癢瘡瘍，皆屬心火，凡諸瘡宜以黃連、當歸為君，甘草、黃芩為佐。凡眼暴發赤腫，痛不可忍者，宜黃連、當歸以酒浸煎之。宿食不消，心下痞滿者，須用黃連、枳實。黃連同西河柳、黃芩、黃柏、石膏、知母、甘草，治痧疹已透而煩躁不止。同當歸、棗仁、圓肉、生地、黃芩、黃柏、黃芪，治火症之盜汗。同槐花、枳殼、乳香、沒藥而治痢純血之腹痛。同五味、麥冬、幹葛而治酒病。同麥冬、五味以治卒消渴之小便多。同人參、蓮子以治虛痢。專為末丸，名瀉心丸，治心實心痛者。同吳茱萸神曲丸，而治肝火之作痛。同白術陳皮神曲丸，名四物丸，治胸中之嘈雜作痛。同白茯苓治思想所緻白淫。同木香丸，名香連丸而治痢。同炮姜末，以治氣痢之後重。

大凡苦寒之藥，多在中品下品，而《神農本草經》謂黃連列于上品者，吾認為，因黃連主治熱氣者，有水滋其火，陰濟其陽之功。其陰中有陽，能濟君火而養神也。