1、是否收費不同，微信收款商業版在自動結算時會收取手續費，行業不同，費率也不同，一般是0.6%，即一天收入1000元，需要繳納6元手續費，實際到賬994元。而個人版收款小賬本的使用則是完全免費的，收到的錢直接進入微信錢包。
2、目的用處不同，微信收款商業版針對于線下門店，以門店為核心，提供豐富的經營與營銷功能。個人版的收款小賬本針對于用個人二維碼收款的小商販，以個人為核心，提供基礎的經營與營銷功能。
3、涵蓋功能不同，個人版的功能都被商業版涵蓋了，并且商業版有許多「小賬本」沒有的功能。商業版的主要功能有收款記錄、支持信用卡付款、自動提現、多門店/多店員管理、官方營銷活動、手機掃碼付款、免費官方物料、收款語音播報、經營報表分析、商品貨架、積分會員。
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