１、殺菌燈：ＵＶ殺菌燈可以破壞生物ＤＮＡ、殺菌，也可以消滅藻類，消除水中的單細胞小球藻。
２、凝結劑：在水中放入凝結劑（明礬），對水裡雜質起絮凝作用，是物理方法，隻能在水質極度渾濁時應急使用。
３、生物控制：使用水蚤把小球藻吃掉，在魚缸中養幾條青苔鼠、清道夫或閃電鼠等能清除藻類的魚，也可以抑制藻類。
４、鹽度控制：小球藻是窄鹽性生物，對鹽度的增加很敏感，所以在水裡加鹽對綠水消除很有幫助。不過同時要注意你的缸中不能有魟魚，或是水草，鹽對他們也有害。
５、用除藻劑：雖然可以除藻，但不建議使用，因為這是一種藥劑，對魚對草都有害。
６、抑制生長：可以減少光照，減少喂食，加強換水，比較安全，缺點是時間會比較長。
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