1、染料：孔雀石綠可用作絲綢、皮革和紙張的染料。商品孔雀石綠染料，是将色素溶于熱草酸溶液，冷卻後得草酸鹽的結晶，2C23H24N2．C2H2O4。或用鹽酸中和後，加定量的氯化鋅ZnCl2結晶出氯化鋅複鹽3C23H25N2CL.2ZnCl2，成為綠色堿性染料，用于染羊毛，絲，皮革等，是專職的染料。
孔雀石綠可用作生物染色劑，把細胞或細胞組織染成藍綠色，方便在顯微鏡下研究，可用于植物病毒感染的宿主細胞染色，細菌、芽胞染色，紅細胞、蛔蟲卵染色。
2、殺菌劑：孔雀石綠可用作治理魚類或魚卵的寄生蟲、真菌或細菌感染，對付真菌Saprolegnia特别有效，漁場的魚卵會感染這種真菌。孔雀石綠也常用作處理受寄生蟲影響的淡水水産。用作抑菌劑或殺阿米巴原蟲劑；對脂鯉和鲶魚等海産動物來說，有高度毒性、高殘留等副作用，故使用時，通常隻下一半份量。
3、用作細菌多醣體試劑。
4、用作臨床診斷試劑(無機磷酸鹽的測定)。
5、用作镓、钽、銻的光度測定；鎢的催化光度測定；點滴試驗亞硫酸鹽和铈、鎢。
6、用作酸堿指示劑，pH 0.0(黃)～2.0(綠)，11.6(藍綠)～14(無色)。
7、用作氧化還原指示劑。
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