靈魂存在于宗教思想中，它指人類超自然及非物質的組成部份，而科學否認靈魂是真實存在的。
宗教都認為靈魂居于人或其他物質軀體之内并對之起主宰作用，大多數信仰都認為亦可脫離這些軀體而獨立存在，不同的宗教和民族對靈魂有不同的解釋。迄今為止，從未發現過客觀存在的任何一種被聲稱的超自然力現象。古人說的靈魂，有時指的是我們今天說的意識、精神、心理活動，那是大腦生理活動的結果，是物理、化學反應的産物，并不能脫離大腦而存在。人一死，大腦活動終止，意識喪失，所謂的靈魂也就跟着消失。這是靈魂不存在的科學依據。
多數科學家現在的看法是，靈魂隻是大腦的一種綜合功能。靈魂是存在的，但隻存在于有生命的活體中，主要是大腦。但他們都認定的一點是當生命停止後靈魂也消失了，因為神經的活動和新陳代謝如同其他組織器官的活動一樣也都停止了。
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