1、科屬區别：子梅魚和小黃魚所屬的綱、目、科都是相同的，但若是再細分的話二者就不同了，因為它們是不同屬、不同種的魚。具體來看，子梅魚屬于梅童魚屬子梅魚種，小黃魚則是黃魚屬小黃魚種。可見，二者是不同的兩種魚，不能将二者混淆。
2、體型區别：子梅魚和小黃魚的體型也是不同的。子梅魚的體型比較小，它們成年之後的身體長度一般在4-10厘米之間，有些比較大的個體可以達到20厘米左右。小黃魚的體型則比較大，它們的身體長度一般都在20厘米左右，比較大的個體可以達到40厘米。
3、頭部區别：二者的頭部也是不同的。子梅魚的頭部比較大而圓鈍，吻部也比較圓鈍；小黃魚的頭部不圓鈍，唇部比較尖。
4、尾部區别：子梅魚和小黃魚的尾巴也是不同的。子梅魚的尾巴比較細，也比較長，尾鳍的形狀是楔形的；小黃魚的尾巴比較短，尾鳍的顔色是雙截形的。
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