若性生活時經常出現性交疼痛，男女雙方都可能存在病理性因素。引起男性性交疼痛有患者自身因素，也有女方因素。
男方自身因素
泌尿系統感染：引起男性性交疼痛的常見原因有泌尿生殖系統感染，包括包皮炎、尿道炎、附屬性腺炎等，炎症本身會造成生殖器及周圍疼痛，在性交時會表現的特别明顯。
陰莖本身異常：包莖、包莖口狹窄、陰莖系帶撕裂或過短、陰莖硬節症、陰莖炎症或手術外傷後産生的纖維瘢痕攣縮也能引起性交疼痛；另外輕度的尿道下裂往往伴有陰莖不同程度彎曲，勃起時即可引起疼痛，性交時，因為陰莖彎曲，在陰道内引起強烈的牽拉疼痛更加明顯。
女方因素
女方白帶增多或陰道酸度改變，陰道痙攣，女性生殖器先天畸形如先天性無陰道、處女膜閉鎖和過厚，陰道瘢痕或縱隔等，男方強行性交會引起雙方性交疼痛。
特别提示：偶然性的性交疼痛患者無需緊張，可能因為性交姿勢不正确、潤滑不足、應用避孕套的型号不對、使用理療環，或性交時壓力過大、性知識缺乏、非陰道式性交、性虐待、性交過頻或重複性性交等因素有關，排除以上因素性交即恢複正常。
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