男性性欲低下的病因很複雜，所有嚴重的全身性疾病、慢性疾病、過度疲勞，都可以降低性興奮，導緻性欲低下。
但實際上這類患者性欲減退隻不過是病變的早期表現，其大多數都會出現其它性功能障礙。許多内分泌疾病，如艾迪生病、庫欣綜合征、高泌乳事宜素血症、垂體功能減退、甲狀腺功能減退等都可引起男性性欲低下。
遺傳性疾病，如克氏綜合征等；肝髒疾病，如慢性活動性肝炎、肝硬化等；營養代謝性疾病，如低血糖、低血鉀、糖尿病、營養不良；
其他如慢性腎功能衰竭、充血性心力衰竭、腦部腫瘤、腦血管疾病、慢性阻塞性肺部疾病、膠原性疾病、寄生蟲感染、前列腺炎、惡性腫瘤等許多疾病都能引起男性性欲低下。
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