1、利用固氮微生物進行生物固氮，既能減少生産投入，又能避免環境污染，且能提高作物産量；
2、利用能夠導緻農業害蟲至病或者分泌物能直接毒死害蟲的微生物，成本低且能維持生态平衡，減少有害物質富集對人體帶來的危害；
3、食用菌是一類能夠為人類直接食用的微生物，農民通過一定的程序大規模培育這種微生物，為人類提供營養豐富的食品；
4、有機肥料是利用農業生産和生活廢棄的有機物料，通過微生物發酵積制而成的含有大量有機質和多種營養元素的肥料。有機肥料本身具有的改土、培肥、增産和改善品質等作用進一步提高；
5、微生物菌肥微生物肥料是以微生物的生命活動導緻作物得到特定肥料效應的一種制品，是農業生産中使用肥料的一種。
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