首先、百日咳是一種由百日咳杆菌引起的急性呼吸道傳染病，自從廣泛實施百日咳菌苗免疫接種後,本病的發生率已經大為減少。百日咳的臨床特征為咳嗽逐漸加重，呈典型的陣發性、痙攣性咳嗽，咳嗽終末出現深長的雞啼樣吸氣性吼聲，病程長達2～3個月，故有百日咳之稱。
其次、一般由百日咳鮑特杆菌（簡稱百日咳杆菌）感染所引起，同屬的支氣管敗血症鮑特杆菌和副百日咳鮑特杆菌亦可引起。百日咳鮑特杆菌是革蘭陰性杆菌，可産生一些緻病物質，包括百日咳毒素、氣管細胞毒素、腺苷酸環化酶毒素、不耐熱毒素以及内毒素等。百日咳毒素可使患者淋巴組織中的淋巴細胞動員到周圍血液及氣管，細胞毒素可特異性損傷氣管纖毛上皮細胞，使之變性、壞死。
最後、在最近幾年，百日咳也會出現在成年人和青少年當中的情況也比較多，不但會咳嗽，而且還會有咳嗽後嘔吐的現象，但也可僅有數周幹咳，罕有并發症。多數患者仍可堅持工作，本人雖無多大痛苦，但可作為傳染源，尤其威脅小兒，應予重視。
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