1、整體上而言，生物信息學碩士學位的就業方向主要在這幾個方面：醫學、生物學、動物學、計算機、健康等。就業領域包括政府研究部門、教育、醫療機構、科研機構等。
2、自然科學經理可以使用生物信息學專業知識向科學家推薦各種分析其特定數據集的方法，通過合作來共同完成一個項目。自然科學經理負責監督科學家的工作，包括化學家，物理學家和生物學家。他們指導與研究和開發相關的活動，并協調測試，質量控制和生産等活動。
3、而一般管理崗位的話，都需要更好的學位，且專業知識不能差，否則無法勝任。因此，生物信息學碩士學位正好足夠。該學位2018統計平均薪資$123,860，預計2016-2026就業增長10%，大體數量上其實比計算機科學家增長的還要多。
4、微生物學家要求最低為該領域的學士學位，但擁有生物信息學碩士學位就擁有更高的薪資，更高的發展起點。該職業主要是進行各種研究實驗來研究微生物，如細菌、病毒、真菌、寄生蟲等。
5、美國勞工局BLS統計表示，該職位平均年薪在$71,650，預計2016-2026就業增長8%，對比整體增長5%，該領域的就業形勢還算不錯。一般都是在搞基礎性研究，主要解決工業生産過程中遇到的問題，并監測環境條件以确保公衆健康和安全等等。
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