由燕京大學直接拆分而成的大學包括中國政法大學（燕京大學法學院）、中央财經大學（燕京大學經濟系）、中央民族大學（燕京大學曆史系）。部分由燕京大學直接拆分的，如清華大學工學院等。
在中國高等學校1952年院系調整中，燕京大學被撤消。中國大陸國民政府遷台後，燕京大學在香港被并入香港中文大學。在中國大陸，其資産由中央人民政府接管後被整并，文科、理科多并入北京大學，工科并入清華大學，法科、社會學系并入北京政法學院（已更名中國政法大學）。校舍由北京大學接收，現在其建築仍為燕京大學古迹。
所以現在主要繼承燕京大學的是北京大學。
燕京大學是20世紀初由四所美國及英國基督教教會聯合在北京開辦的大學，也是近代中國規模最大、質量最好、環境最優美的大學之一，創辦于1919年，創始人司徒雷登長期擔任燕大校長、校務長。1928年春，燕京大學與美國哈佛大學合作成立哈佛燕京學社，到1930年代已經跻身于世界一流大學之列，在國内外名聲大震。
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