1、《飛虎2》講述了展瀚韬（馬德鐘飾）所領導的飛虎隊行動組A Team，經過一年的合作和鍛鍊，各隊員漸見成熟，合作更具默契，而面對的新挑戰亦接踵而來。随著舊拍檔相繼離隊，俞學禮（羅仲謙飾）等A Team成員搖身一變成大師兄，以身作則帶領一批九十後新隊員。當衆下屬認定瀚韬是升任總督察的最佳人選，總督察潘子龍卻由刑事情報科空降成為瀚韬的上司，衆隊員大表詫異之馀，亦要重新适應子龍的新作風。
2、瀚韬的「最佳拍檔」、飛虎隊狙擊手莊卓源（梁烈唯飾），與女友丁慧慧（苟芸慧飾）彼此認定為終身伴侶，但卓源卻發現慧慧舉動異常而不勝煩惱。卓源在一次行動中擊斃匪徒後，若有所思，開始對開槍感猶疑，更萌生離開飛虎的想法。另一方面，一心成為女飛虎的蘇文強（黃智雯飾），經過多重辛苦訓練，終如願如償。文強與學禮日久生情，二人正欲确認彼此關系時，學禮曾保護的富家女舒子麗再度出現，成為二人感情發展的牽絆。
3、在一次行動中，一名飛虎隊員卻被指違反守則需接受聆訊。其他隊員對此忿忿不平，團結一緻保護犯錯隊友，惟瀚韬公正不阿直斥其非。衆隊員有感瀚韬處事固執，向來團結的A Team竟面臨四分五裂的危機，瀚韬該如何化解。
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