在鑒别菩提根的時候，可以通過火燒法、泡水法或者摸手感進行區分，天然的菩提根通過火燒下會有一種燒糊的味道，泡水後會慢慢沉下去，表面上的紋理大小不宜。而假品經過火燒後會發出一種刺激性的氣味。
1、火燒法在鑒别菩提根的真假的時候，可以通過火燒法進行辨别，天然的菩提根含有一種特殊的香味，将其放在打火機上面烘烤，會聞到木質燒焦的味道，而假的菩提根大多是以塑料的材質制成，經過火燒後容易出現刺激性氣味。
2、泡水法也可以通過泡水法進行區分，天然的菩提根是植物的種子或者果實，内部的結構緻密且堅硬，經過泡水後會慢慢的沉下去，而假的菩提根經過人工處理後，其内部結構遭到了破壞，泡水後會很快浮出水面。
3、摸手感也可以通過摸手感進行辨别，天然形成的菩提根上面會有很多大小不一的紋理，深淺不一，每個縫隙之間的張力也不同，摸上去會有點紮手的感覺，而假品上的紋理比較均勻，且大小一緻，經過打磨後會顯得比較光亮。
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