1、所屬的單位不同，中國證券業協會屬于非營利性社會團體，中國證監會則是國務院直屬正部級事業單位，屬于國家的職能部門，按照法律、法規和國務院授權，統一監督管理全國證券期貨市場。
2、人員配置不同，中國證券業協會人員不固定，會員不領工資，必須接受中國證監會和國家民政部的業務指導與監督管理；中國證監會設在北京，機關内設有21個職能部門，1個稽查總隊和3個中心。
3、職責不同，中國證券業協會的主要職責包括教育和組織會員遵守證券法律、行政法規，依法維護會員的合法權益，制定會員應遵守的規則，組織會員單位的從業人員的業務培訓，開展會員間的業務交流等等；中國證監會的職責是研究和拟訂證券期貨市場的方針政策、發展規劃；起草證券期貨市場的有關法律、法規，提出制定和修改的建議；制定有關證券期貨市場監管的規章、規則和辦法等等。
4、中國證券業協會是自律組織，服務機構，而證監會是監督機構，中國證券業協會主要負責行業内消息、咨詢、業務的研究和交流，中國證監會統一監督管理全國證券期貨市場，維護證券期貨的市場秩序，保障其合法運行，員工是國家公務員。
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