蜂巢的内部結構稱為蜂房，蜂房由一系列以蜂蠟制作，緊密排列的六角柱體蜂室所組成，這種六角形所排列而成的結構叫做蜂窩結構。蜂巢内外面的巢穴剛好一半相互錯開，相互組合六角形的邊交叉的點是内側六角形的中心。這是為了提高強度，防止巢房底破裂。另外，從剖面圖可知，兩面的巢房方向都是朝上的。工蜂在巢房中哺育幼蟲，貯藏蜂蜜和花粉，蜂巢形成9至14度左右的角度，以防止蜂蜜流出。
蜂巢藥用價值很高，常用新鮮幹淨的蜂巢治療鼻炎。研究表明，蜂巢制劑有促進機體細胞免疫功能的作用，蜂巢浸液既對乙型肝炎表面抗原有滅活作用，也對金黃色葡萄球菌、綠膿杆菌、大腸杆菌、痢疾杆菌、傷寒杆菌和普通變形杆菌等都有很強的抑制力；對煙曲黴、黃曲黴、茄鐮菌、明串珠菌等真菌也有抑制作用。蜂巢的化學成分很複雜，主要含有蜂蠟、樹脂、油脂、色素、鞣質、糖類、有機酸、脂肪酸、甙類、酶和昆蟲激素等。
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