因附睾炎有急性與慢性之分，所以治療也有所側重。 對于急性附睾炎主張患者卧床休息，托起陰囊，以減輕疼痛。早期可将冰袋放在附睾處，防止腫脹。晚期可用熱敷，以促進局部血運，加速炎症消退。因屬于感染，故應進行抗感染治療，臨床上多選用廣譜抗生素及對革蘭氏陰性菌效果較佳的抗生素。對于疼痛、發熱等全身症狀，應用解熱鎮痛藥對症處理。如果附睾疼痛較重可請專科醫師予1%利多卡因10～20毫升由睾丸上端處行精索局部封閉，可起到止痛、解除墜脹作用。如果附睾炎性包塊增大，陰囊皮膚紅腫且有波動感，形成膿腫則須行切開引流。因留置導尿管招緻本病者，應拔除尿管。另外，急性期期間要避免性沖動和重體力活動，以免加重感染和症狀。對少數頑固病人且病情控制不理想，可行附睾甚至包括睾丸切除術。
因慢性附睾炎常與慢性前列腺炎同時存在，所以治療時二病同治。
(1)注意生活規律化，勞逸結合，忌煙酒及辛辣刺激。
(2)保持大便通暢。
(3)避免長時間久坐。
(4)性生活不宜過頻。
(5)溫水坐浴，2次/日，水溫控制在42℃～50℃，每次20～30分鐘。
(6)黃連素或新黴素離子透入。
如果慢性附睾炎有多次反複發作者，可考慮做附睾切除。值得重視的是，無論急性還是慢性附睾炎，如為雙側發生，均有導緻不育的可能，故發生附睾炎應及時治療。
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