黑臭水的顔色測定包括了水體的透明度和色度兩個方面的指标，其本身的特點也與其他狀态有很大不同。黑臭水，目前的主流定義是以溶解氧、臭阈值、透明度和色度四個指标進行水體質量考量，其中有一項不達标就可稱為黑臭水體。
一般選擇與水體黑臭生化過程有關的一些參數，進行了現場和模拟試驗測定研究，結果證明DO、BOD_5、硫酸還原菌數等，與水體黑臭具有較好的相關性。黑臭狀态是水體，其理化環境表現為強還原性質，有機無機污染極其嚴重，水有一種異味産生，水生生物不能再生存，水生植被退化甚至滅絕，浮遊植物、浮遊動物、底栖動物隻有少量耐污種存在。這樣就影響食物鍊，生物開始退化甚至消失，整個環境遭受破壞。
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