蛋白聚糖，是一類特殊的糖蛋白，由一條或多條糖胺聚糖和一個核心蛋白共價鍊接而成。它不僅分布于細胞外基質，也存在于細胞表面以及細胞内的分泌顆粒中，是結締組織主要成分之一。其主要功能是作為結締組織的纖維成分（膠原和彈性蛋白）埋置或被覆的基質，也可當作墊組織使關節滑潤。
蛋白聚糖的生物合成：
包括肽鍊的合成及糖鍊的合成。核心蛋白質肽鍊的合成是蛋白聚糖合成的限速步驟，在粗面内質網進行，其過程與一般蛋白質相同。肽鍊的糖基化在内質網起始，在戈爾吉氏體完成。氨基聚糖糖鍊的合成過程與糖蛋白者類似。亦由一系列糖基轉移酶催化逐個将活化單糖的糖基轉移到肽鍊及未完成的糖鍊，使之不斷延長。糖基的硫酸化是在糖鍊的延長過程中進行的。由硫酸基轉移酶催化，從磷酸腺苷磷酸硫酸轉移硫酸基到糖基，糖鍊中的艾杜糖醛酸是由葡萄糖醛酸基在差向異構酶催化下發生旋光異構化形成的。
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