水産養殖中由于集約化的養殖方式，養殖水域受到不同程度的水質污染，水質發生污染，會導緻各種微生物細菌大量繁殖，各種原因水中微生物超标容易對養殖造成嚴重的危害，導緻養殖魚蝦發病，引起大面積死亡等嚴重後果，水産養殖中，消毒劑是必不可少的。消毒劑可以殺滅水中微生物，淨化水質，消毒劑在水産養殖中被廣泛使用。
水産養殖中常用的幾種消毒劑：
漂白粉漂白粉一般适用于清塘時道毒：漂白粉可以殺死水體中的生物，不适于養殖時期使用；
高錳酸鉀用作消毒劑、除臭劑、水質淨化劑。高錳酸鉀為強氧化劑，遇有機物即放出新生态氧而且有殺滅細菌作用，殺菌力極強，但極易為有機物所減弱，故作用表淺而不持久。
生石灰生石灰在幹燥狀态無消毒殺菌作用，當石灰接觸到濕的物體才能顯示堿性才具有殺菌的作用，生石灰在使用時，使用不當會起反作用。
過硫酸氫鉀是強氧化劑，可以中和亞硝酸鹽，一般用作消毒改底。
殺菌效果強，見效快，消毒作用強。可以殺水體中的藻類，使用不當可能會出現倒藻。
甲醛類消毒劑甲醛類消毒劑一般是在清塘時使用，因為它的揮發性強使得池底不會有殘留物，因而成為養殖戶們清塘的選擇之一。值得注意的是，甲醛不能用金屬容器儲存，應該用有色玻璃進行密封保存并放置于陰涼處。
二氯海因二氣海因含氯含量高，氣味輕，作用溫和，殺菌所需濃度高，作用時間較長，有效氯釋放緩慢。
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