頭皮真菌感染後會形成頭癬，頭癬是具有傳染性的。所以治療頭皮真菌感染有以下幾種治療方式。
要将頭發剪短或者剃光，并且使用醫用洗發水洗頭，通常使用頻率為一周兩次，使用頻率可根據患者症狀來進行調整。
也可以選用硫磺皂、酮康唑洗劑來進行對感染部位清洗，并且使用一些外用軟膏擦拭患處，例如：益康唑軟膏、萘替芬酮康唑乳膏。
除了使用一些外用的藥物，還可以使用口服的藥物進行治療比如：伊曲康唑膠囊、特比萘芬片等。這幾類藥物都可以有效的抑制緻病菌的繁殖。
治療此疾病的療程較長，往往能達到一個月以上。所以不光需要注意殺菌、消毒的處理，還要注意日常的飲食，不能吃刺激性的食物，吸煙和喝酒也需要控制。
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